南京财经大学公共财政研究中心成立于2009年7月，于2010年7月被遴选为江苏省高校哲学社会科学重点研究基地，是江苏省教育厅和南京财经大学共同设立、共同建设的省级重点研究基地。

该中心以应用经济学、理论经济学、公共管理和法学等一级学科为支撑，深刻把握中国财税体制变革的节奏与特征，以地方政府财税制度创新与变革研究作为主要特色，构建以项目化运作为主导的科研组织和管理模式，组建和培养一支具有学术竞争力和社会影响力的精英科研团队，主要开展应用性和政策性研究，致力于将中心建设成为在国内具有影响力和一定权威性的财税科学研究机构和政府财政决策咨询机构。

该中心实行中心主任负责制，现任正副主任各一名；中心设有专门的学术委员会，学术委员会是中心学术研究的指导机构，负责制定中心的学术发展规划和指导中心的科学研究工作；中心现有专兼职科研人员近30人，主要从事社会保障制度与管理、教育财政理论与政策、公共政策与产业发展、地方财政制度与管理、税收制度与政策等领域的研究。

遴选为省重点研究基地一年以来，中心各研究团队在研与新立项各类纵向和横向课题29项，其中国家级课题5项，省部级课题8项，厅级课题6项，国际项目2项。中心专兼职科研人员新近发表学术论文共40余篇,其中发表于《经济研究》《中国工业经济》《财政研究》《税务研究》《经济学动态》《教育与经济》等权威期刊以及CSSCI来源期刊20余篇；已出版学术著作和教材各3部。